MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 117462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015576	C	6	6	104	109	0 %	0 %	0 %	100 %	333988641
2	NC_015576	TCG	2	6	149	154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988641
3	NC_015576	CAG	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988641
4	NC_015576	CCG	2	6	230	235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988641
5	NC_015576	CGT	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988641
6	NC_015576	CGA	2	6	297	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988641
7	NC_015576	CAC	2	6	303	308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988641
8	NC_015576	TCG	2	6	313	318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988641
9	NC_015576	TGC	2	6	330	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988641
10	NC_015576	CGA	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988641
11	NC_015576	GAC	3	9	364	372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988641
12	NC_015576	ACT	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988641
13	NC_015576	TGA	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988641
14	NC_015576	CCG	2	6	437	442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988641
15	NC_015576	CGC	2	6	513	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988641
16	NC_015576	CG	3	6	543	548	0 %	0 %	50 %	50 %	333988641
17	NC_015576	GTT	2	6	561	566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988641
18	NC_015576	CTG	2	6	601	606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988641
19	NC_015576	CGC	2	6	609	614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988641
20	NC_015576	TCA	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988641
21	NC_015576	CGA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988641
22	NC_015576	GAC	2	6	763	768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988641
23	NC_015576	AAG	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988641
24	NC_015576	AGG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988641
25	NC_015576	TTC	2	6	808	813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988641
26	NC_015576	CAA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988641
27	NC_015576	CCGA	2	8	863	870	25 %	0 %	25 %	50 %	333988641
28	NC_015576	AAG	2	6	982	987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988641
29	NC_015576	CCA	2	6	1037	1042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988641
30	NC_015576	TGC	2	6	1145	1150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988641
31	NC_015576	ATC	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988641
32	NC_015576	GAG	2	6	1237	1242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988641
33	NC_015576	ACCAC	2	10	1358	1367	40 %	0 %	0 %	60 %	333988641
34	NC_015576	ACC	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988641
35	NC_015576	GC	3	6	1461	1466	0 %	0 %	50 %	50 %	333988641
36	NC_015576	GTGG	2	8	2101	2108	0 %	25 %	75 %	0 %	333988642
37	NC_015576	GTT	2	6	2140	2145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988642
38	NC_015576	TGC	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988642
39	NC_015576	GGC	2	6	2227	2232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988642
40	NC_015576	GCT	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988642
41	NC_015576	GAG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988642
42	NC_015576	GGC	2	6	2479	2484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988642
43	NC_015576	CGGG	2	8	2485	2492	0 %	0 %	75 %	25 %	333988642
44	NC_015576	GCC	2	6	2555	2560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988642
45	NC_015576	CGG	2	6	2601	2606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988642
46	NC_015576	GCG	2	6	2621	2626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988642
47	NC_015576	GCC	2	6	2657	2662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988642
48	NC_015576	CTG	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988642
49	NC_015576	CAG	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988642
50	NC_015576	GCA	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988642
51	NC_015576	GCT	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988642
52	NC_015576	CCA	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988642
53	NC_015576	GC	3	6	2898	2903	0 %	0 %	50 %	50 %	333988642
54	NC_015576	CCG	2	6	2943	2948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988642
55	NC_015576	GGA	2	6	2953	2958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988642
56	NC_015576	GC	3	6	2965	2970	0 %	0 %	50 %	50 %	333988642
57	NC_015576	GAG	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988642
58	NC_015576	AAG	2	6	3095	3100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988642
59	NC_015576	TGC	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988642
60	NC_015576	CCGG	2	8	3116	3123	0 %	0 %	50 %	50 %	333988642
61	NC_015576	GAC	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988642
62	NC_015576	GCG	2	6	3144	3149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988642
63	NC_015576	CGG	2	6	3162	3167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988642
64	NC_015576	TTG	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988643
65	NC_015576	GGT	2	6	3458	3463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988643
66	NC_015576	TCG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988643
67	NC_015576	CGC	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988643
68	NC_015576	CAA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988643
69	NC_015576	GTC	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988643
70	NC_015576	TGC	2	6	3586	3591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988643
71	NC_015576	GTT	2	6	3599	3604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988643
72	NC_015576	G	6	6	3631	3636	0 %	0 %	100 %	0 %	333988643
73	NC_015576	GCG	3	9	3647	3655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988643
74	NC_015576	CGA	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988643
75	NC_015576	GCCG	2	8	3682	3689	0 %	0 %	50 %	50 %	333988643
76	NC_015576	CGG	2	6	3697	3702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988643
77	NC_015576	TGC	2	6	3724	3729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988643
78	NC_015576	GCT	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988643
79	NC_015576	CGGT	2	8	3783	3790	0 %	25 %	50 %	25 %	333988643
80	NC_015576	GCC	2	6	3849	3854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988643
81	NC_015576	CGG	2	6	3931	3936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988643
82	NC_015576	GGC	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988643
83	NC_015576	CTG	2	6	4008	4013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988643
84	NC_015576	GCG	2	6	4028	4033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988643
85	NC_015576	CG	3	6	4035	4040	0 %	0 %	50 %	50 %	333988643
86	NC_015576	GT	3	6	4054	4059	0 %	50 %	50 %	0 %	333988643
87	NC_015576	GGTC	2	8	4064	4071	0 %	25 %	50 %	25 %	333988643
88	NC_015576	CGA	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988643
89	NC_015576	CCGG	2	8	4106	4113	0 %	0 %	50 %	50 %	333988643
90	NC_015576	GCCA	2	8	4125	4132	25 %	0 %	25 %	50 %	333988643
91	NC_015576	GGC	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988643
92	NC_015576	CTG	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988643
93	NC_015576	CGA	2	6	4220	4225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988643
94	NC_015576	CGC	3	9	4251	4259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988643
95	NC_015576	GCC	3	9	4275	4283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988643
96	NC_015576	CCG	3	9	4303	4311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988643
97	NC_015576	TGA	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988643
98	NC_015576	CGG	2	6	4327	4332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988643
99	NC_015576	GAC	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988643
100	NC_015576	ACC	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988644
101	NC_015576	CGG	2	6	4484	4489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988644
102	NC_015576	GC	3	6	4502	4507	0 %	0 %	50 %	50 %	333988644
103	NC_015576	GCG	2	6	4511	4516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988644
104	NC_015576	CGG	2	6	4565	4570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988644
105	NC_015576	G	6	6	4576	4581	0 %	0 %	100 %	0 %	333988644
106	NC_015576	GCC	3	9	4590	4598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988644
107	NC_015576	GGT	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988644
108	NC_015576	GGT	2	6	4726	4731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988644
109	NC_015576	CGC	2	6	4858	4863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988644
110	NC_015576	GTG	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988644
111	NC_015576	CGT	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988644
112	NC_015576	CG	3	6	4959	4964	0 %	0 %	50 %	50 %	333988644
113	NC_015576	GTAT	2	8	5308	5315	25 %	50 %	25 %	0 %	333988645
114	NC_015576	GTC	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988645
115	NC_015576	CGG	2	6	5432	5437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988645
116	NC_015576	CGT	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988645
117	NC_015576	CGG	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988645
118	NC_015576	CGG	2	6	5567	5572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988645
119	NC_015576	CGGCGT	2	12	5579	5590	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333988645
120	NC_015576	GGT	2	6	5594	5599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988645
121	NC_015576	GAA	2	6	5690	5695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988645
122	NC_015576	CAC	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988645
123	NC_015576	ACC	2	6	5760	5765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988645
124	NC_015576	GCG	2	6	5789	5794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988645
125	NC_015576	CAA	2	6	5816	5821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988645
126	NC_015576	GAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988645
127	NC_015576	GTC	2	6	5868	5873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988645
128	NC_015576	GTC	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988645
129	NC_015576	CCG	2	6	5893	5898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988645
130	NC_015576	CCG	2	6	5911	5916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988645
131	NC_015576	GCC	2	6	5925	5930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988645
132	NC_015576	CGG	2	6	5978	5983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988645
133	NC_015576	TCG	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988645
134	NC_015576	CGG	2	6	6098	6103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988645
135	NC_015576	CCG	2	6	6145	6150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988645
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259	NC_015576	TGG	2	6	10741	10746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988646
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261	NC_015576	GAG	2	6	10782	10787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988646
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381	NC_015576	GGCC	2	8	16309	16316	0 %	0 %	50 %	50 %	333988655
382	NC_015576	GCC	2	6	16352	16357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988655
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384	NC_015576	CGG	2	6	16523	16528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988655
385	NC_015576	CAC	2	6	16541	16546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988655
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500	NC_015576	GC	3	6	20743	20748	0 %	0 %	50 %	50 %	333988657

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